簡化甲基化測序
DNA甲基化是表觀遺傳學的重要組成部分,在維持正常細胞功能、遺傳印記、胚胎發育以及人類腫瘤發生中起著重要的作用。針對全基因組甲基化測序成本相對昂貴,即產生了簡化甲基化測序,該方法通過酶切富集啟動子及CpG島區域,硫化處理及片段富集,構建文庫后進行測序,同時實現DNA甲基化狀態檢測的高分辨率和測序數據的高利用率。
利用限制性內切酶對基因組進行酶切,可以極大幅度的提高CpG區域的測序深度,與全基因組甲基化測序相比減少大量的測序量,在CpG島、啟動子區域和增強子元件區域可以達到高精度分辨率。同時,利用RRBS可以實現多個樣本的比對基因組分析。
1、數據產出統計及基本的數據質控處理
2、測序數據與目的物種基因組進行比對
3、胞嘧啶C的測序深度統計
4、Promoter和CpG島上覆蓋度及甲基化分析
5、鑒定胞嘧啶C堿基的甲基化狀態及在基因組上的分布
1、DNA樣品總量:簡化甲基化測序需要提供2μg的基因組DNA;為保證實驗質量及延續性,請一次性提供至少2次樣本制備量;
2、樣品濃度和純度:基因組DNA樣品濃度>50ng/μl; OD260/280介于1.8-2.0,無肉眼可見污染;
3、樣品保存:請選擇乙醇、純水進行保存,并在樣品信息單中注明;
4、樣品運輸:請將樣品置于1.5ml管中,并用封口膜封好。
飛凡檢測質檢報告流程:
1、 提供產品資料
2、 工程師根據您品資料的產品推薦合適檢測項目,并給出報價
3、 確認報價沒有問題,然后把樣品送到我們實驗室
4、 支付檢測費用,安排檢測
5、檢測完成,出具檢測報告,郵寄給客戶
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